三芝區位於台灣本島最北端稍微偏西，約在東經121度、北緯25度之間，北邊與石門區和金山區毗鄰，南邊與淡水區相接，東連大屯山脈和台北市北投區陽明山分界，西鄰台灣海峽，與大陸福州遙對，唯一背山面海，風景秀麗的鄉村。
本鄉開拓以前，係為Vayi番社所踞，稱為小雞籠社，境內森林蓊鬱，漢人入居後成為小雞(圭)籠莊，又作小圭郎，本區的所在地小基隆即取自小基隆字音的轉變，以及本鄉往昔是凱達格蘭族的分佈地區。
而雞籠是由凱達格蘭族採用自己族名Ketagalan譯音而取名的。清末編隸芝蘭三堡，日治後，於民1920改正地方行政制度，乃取芝蘭三堡為三芝，小雞籠遞衍為三芝的名稱，於焉告成，戰後實行新制，改為三芝區。
